Rosetta Utilities  2014.35
Namespaces | Functions | Variables
basic::options::OptionKeys::docking::ligand Namespace Reference

Namespaces

 grid
 

Functions

BooleanOptionKey const ligand ("docking:ligand")
 
StringOptionKey const protocol ("docking:ligand:protocol")
 
BooleanOptionKey const soft_rep ("docking:ligand:soft_rep")
 
BooleanOptionKey const tweak_sxfn ("docking:ligand:tweak_sxfn")
 
BooleanOptionKey const old_estat ("docking:ligand:old_estat")
 
BooleanOptionKey const random_conformer ("docking:ligand:random_conformer")
 
IntegerOptionKey const improve_orientation ("docking:ligand:improve_orientation")
 
BooleanOptionKey const mutate_same_name3 ("docking:ligand:mutate_same_name3")
 
RealOptionKey const subset_to_keep ("docking:ligand:subset_to_keep")
 
RealOptionKey const min_rms ("docking:ligand:min_rms")
 
IntegerOptionKey const max_poses ("docking:ligand:max_poses")
 
BooleanOptionKey const minimize_ligand ("docking:ligand:minimize_ligand")
 
RealOptionKey const harmonic_torsions ("docking:ligand:harmonic_torsions")
 
BooleanOptionKey const use_ambig_constraints ("docking:ligand:use_ambig_constraints")
 
IntegerOptionKey const shear_moves ("docking:ligand:shear_moves")
 
BooleanOptionKey const minimize_backbone ("docking:ligand:minimize_backbone")
 
RealOptionKey const harmonic_Calphas ("docking:ligand:harmonic_Calphas")
 
RealOptionKey const tether_ligand ("docking:ligand:tether_ligand")
 
RealVectorOptionKey const start_from ("docking:ligand:start_from")
 
StringOptionKey const option_file ("docking:ligand:option_file")
 

Variables

BooleanOptionKey const ligand
 
StringOptionKey const protocol
 
BooleanOptionKey const soft_rep
 
BooleanOptionKey const tweak_sxfn
 
BooleanOptionKey const old_estat
 
BooleanOptionKey const random_conformer
 
IntegerOptionKey const improve_orientation
 
BooleanOptionKey const mutate_same_name3
 
RealOptionKey const subset_to_keep
 
RealOptionKey const min_rms
 
IntegerOptionKey const max_poses
 
BooleanOptionKey const minimize_ligand
 
RealOptionKey const harmonic_torsions
 
BooleanOptionKey const use_ambig_constraints
 
IntegerOptionKey const shear_moves
 
BooleanOptionKey const minimize_backbone
 
RealOptionKey const harmonic_Calphas
 
RealOptionKey const tether_ligand
 
RealVectorOptionKey const start_from
 
StringOptionKey const option_file
 

Function Documentation

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::harmonic_Calphas ( "docking:ligand:harmonic_Calphas"  )
RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::harmonic_torsions ( "docking:ligand:harmonic_torsions"  )
IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::improve_orientation ( "docking:ligand:improve_orientation"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::ligand ( "docking:ligand"  )
IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::max_poses ( "docking:ligand:max_poses"  )
RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::min_rms ( "docking:ligand:min_rms"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::minimize_backbone ( "docking:ligand:minimize_backbone"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::minimize_ligand ( "docking:ligand:minimize_ligand"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::mutate_same_name3 ( "docking:ligand:mutate_same_name3"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::old_estat ( "docking:ligand:old_estat"  )
StringOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::option_file ( "docking:ligand:option_file"  )
StringOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::protocol ( "docking:ligand:protocol"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::random_conformer ( "docking:ligand:random_conformer"  )
IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::shear_moves ( "docking:ligand:shear_moves"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::soft_rep ( "docking:ligand:soft_rep"  )
RealVectorOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::start_from ( "docking:ligand:start_from"  )
RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::subset_to_keep ( "docking:ligand:subset_to_keep"  )
RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::tether_ligand ( "docking:ligand:tether_ligand"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::tweak_sxfn ( "docking:ligand:tweak_sxfn"  )
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::use_ambig_constraints ( "docking:ligand:use_ambig_constraints"  )

Variable Documentation

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::harmonic_Calphas("docking:ligand:harmonic_Calphas")

Referenced by add_rosetta_options_2().

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::harmonic_torsions("docking:ligand:harmonic_torsions")

Referenced by add_rosetta_options_1().

IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::improve_orientation("docking:ligand:improve_orientation")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::ligand("docking:ligand")

Referenced by add_rosetta_options_1().

IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::max_poses("docking:ligand:max_poses")

Referenced by add_rosetta_options_1().

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::min_rms("docking:ligand:min_rms")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::minimize_backbone("docking:ligand:minimize_backbone")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::minimize_ligand("docking:ligand:minimize_ligand")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::mutate_same_name3("docking:ligand:mutate_same_name3")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::old_estat("docking:ligand:old_estat")

Referenced by add_rosetta_options_1().

StringOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::option_file("docking:ligand:option_file")

Referenced by add_rosetta_options_2().

StringOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::protocol("docking:ligand:protocol")
BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::random_conformer("docking:ligand:random_conformer")

Referenced by add_rosetta_options_1().

IntegerOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::shear_moves("docking:ligand:shear_moves")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::soft_rep("docking:ligand:soft_rep")

Referenced by add_rosetta_options_1().

RealVectorOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::start_from("docking:ligand:start_from")

Referenced by add_rosetta_options_2().

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::subset_to_keep("docking:ligand:subset_to_keep")

Referenced by add_rosetta_options_1().

RealOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::tether_ligand("docking:ligand:tether_ligand")

Referenced by add_rosetta_options_2().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::tweak_sxfn("docking:ligand:tweak_sxfn")

Referenced by add_rosetta_options_1().

BooleanOptionKey const basic::options::OptionKeys::docking::ligand::use_ambig_constraints("docking:ligand:use_ambig_constraints")

Referenced by add_rosetta_options_1().