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evaluation Namespace Reference

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BooleanOptionKey const evaluation ("evaluation")
 
FileVectorOptionKey const rmsd_target ("evaluation:rmsd_target")
 
StringVectorOptionKey const rmsd_column ("evaluation:rmsd_column")
 
FileVectorOptionKey const rmsd_select ("evaluation:rmsd_select")
 
FileVectorOptionKey const align_rmsd_target ("evaluation:align_rmsd_target")
 
FileVectorOptionKey const structural_similarity ("evaluation:structural_similarity")
 
BooleanOptionKey const contact_map ("evaluation:contact_map")
 
StringVectorOptionKey const jscore_evaluator ("evaluation:jscore_evaluator")
 
StringVectorOptionKey const align_rmsd_column ("evaluation:align_rmsd_column")
 
FileVectorOptionKey const align_rmsd_fns ("evaluation:align_rmsd_fns")
 
StringOptionKey const align_rmsd_format ("evaluation:align_rmsd_format")
 
StringOptionKey const rms_type ("evaluation:rms_type")
 
StringOptionKey const predicted_burial_fn ("evaluation:predicted_burial_fn")
 
FileOptionKey const pool ("evaluation:pool")
 
FileVectorOptionKey const rmsd ("evaluation:rmsd")
 
FileVectorOptionKey const chirmsd ("evaluation:chirmsd")
 
BooleanOptionKey const gdtmm ("evaluation:gdtmm")
 
BooleanOptionKey const gdttm ("evaluation:gdttm")
 
BooleanOptionKey const score_with_rmsd ("evaluation:score_with_rmsd")
 
FileVectorOptionKey const constraints ("evaluation:constraints")
 
FileVectorOptionKey const constraints_column ("evaluation:constraints_column")
 
FileVectorOptionKey const combined_constraints ("evaluation:combined_constraints")
 
FileVectorOptionKey const combined_constraints_column ("evaluation:combined_constraints_column")
 
IntegerOptionKey const combine_statistics ("evaluation:combine_statistics")
 
StringVectorOptionKey const chemical_shifts ("evaluation:chemical_shifts")
 
StringOptionKey const sparta_dir ("evaluation:sparta_dir")
 
StringVectorOptionKey const cam_shifts ("evaluation:cam_shifts")
 
StringVectorOptionKey const pales ("evaluation:pales")
 
FileVectorOptionKey const extra_score ("evaluation:extra_score")
 
FileVectorOptionKey const extra_score_patch ("evaluation:extra_score_patch")
 
StringVectorOptionKey const extra_score_column ("evaluation:extra_score_column")
 
FileVectorOptionKey const extra_score_select ("evaluation:extra_score_select")
 
FileVectorOptionKey const rdc_target ("evaluation:rdc_target")
 
BooleanOptionKey const symmetric_rmsd ("evaluation:symmetric_rmsd")
 
StringVectorOptionKey const rdc_column ("evaluation:rdc_column")
 
StringVectorOptionKey const rdc ("evaluation:rdc")
 
StringOptionKey const built_in_rdc ("evaluation:built_in_rdc")
 
BooleanOptionKey const jump_nr ("evaluation:jump_nr")
 
IntegerVectorOptionKey const score_exclude_res ("evaluation:score_exclude_res")
 
IntegerOptionKey const score_sscore_short_helix ("evaluation:score_sscore_short_helix")
 
IntegerOptionKey const score_sscore_maxloop ("evaluation:score_sscore_maxloop")
 
IntegerOptionKey const window_size ("evaluation:window_size")
 
StringOptionKey const I_sc ("evaluation:I_sc")
 
BooleanOptionKey const Irms ("evaluation:Irms")
 
BooleanOptionKey const Ca_Irms ("evaluation:Ca_Irms")
 
BooleanOptionKey const Fnat ("evaluation:Fnat")
 
BooleanOptionKey const Lrmsd ("evaluation:Lrmsd")
 
BooleanOptionKey const Fnonnat ("evaluation:Fnonnat")
 
BooleanOptionKey const DockMetrics ("evaluation:DockMetrics")
 

Function Documentation

StringVectorOptionKey const evaluation::align_rmsd_column ( "evaluation:align_rmsd_column"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::align_rmsd_fns ( "evaluation:align_rmsd_fns"  )
StringOptionKey const evaluation::align_rmsd_format ( "evaluation:align_rmsd_format"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::align_rmsd_target ( "evaluation:align_rmsd_target"  )
StringOptionKey const evaluation::built_in_rdc ( "evaluation:built_in_rdc"  )
BooleanOptionKey const evaluation::Ca_Irms ( "evaluation:Ca_Irms"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::cam_shifts ( "evaluation:cam_shifts"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::chemical_shifts ( "evaluation:chemical_shifts"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::chirmsd ( "evaluation:chirmsd"  )
IntegerOptionKey const evaluation::combine_statistics ( "evaluation:combine_statistics"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::combined_constraints ( "evaluation:combined_constraints"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::combined_constraints_column ( "evaluation:combined_constraints_column"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::constraints ( "evaluation:constraints"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::constraints_column ( "evaluation:constraints_column"  )
BooleanOptionKey const evaluation::contact_map ( "evaluation:contact_map"  )
BooleanOptionKey const evaluation::DockMetrics ( "evaluation:DockMetrics"  )
BooleanOptionKey const evaluation::evaluation ( "evaluation"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::extra_score ( "evaluation:extra_score"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::extra_score_column ( "evaluation:extra_score_column"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::extra_score_patch ( "evaluation:extra_score_patch"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::extra_score_select ( "evaluation:extra_score_select"  )
BooleanOptionKey const evaluation::Fnat ( "evaluation:Fnat"  )
BooleanOptionKey const evaluation::Fnonnat ( "evaluation:Fnonnat"  )
BooleanOptionKey const evaluation::gdtmm ( "evaluation:gdtmm"  )
BooleanOptionKey const evaluation::gdttm ( "evaluation:gdttm"  )
StringOptionKey const evaluation::I_sc ( "evaluation:I_sc"  )
BooleanOptionKey const evaluation::Irms ( "evaluation:Irms"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::jscore_evaluator ( "evaluation:jscore_evaluator"  )
BooleanOptionKey const evaluation::jump_nr ( "evaluation:jump_nr"  )
BooleanOptionKey const evaluation::Lrmsd ( "evaluation:Lrmsd"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::pales ( "evaluation:pales"  )
FileOptionKey const evaluation::pool ( "evaluation:pool"  )
StringOptionKey const evaluation::predicted_burial_fn ( "evaluation:predicted_burial_fn"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::rdc ( "evaluation:rdc"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::rdc_column ( "evaluation:rdc_column"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::rdc_target ( "evaluation:rdc_target"  )
StringOptionKey const evaluation::rms_type ( "evaluation:rms_type"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::rmsd ( "evaluation:rmsd"  )
StringVectorOptionKey const evaluation::rmsd_column ( "evaluation:rmsd_column"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::rmsd_select ( "evaluation:rmsd_select"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::rmsd_target ( "evaluation:rmsd_target"  )
IntegerVectorOptionKey const evaluation::score_exclude_res ( "evaluation:score_exclude_res"  )
IntegerOptionKey const evaluation::score_sscore_maxloop ( "evaluation:score_sscore_maxloop"  )
IntegerOptionKey const evaluation::score_sscore_short_helix ( "evaluation:score_sscore_short_helix"  )
BooleanOptionKey const evaluation::score_with_rmsd ( "evaluation:score_with_rmsd"  )
StringOptionKey const evaluation::sparta_dir ( "evaluation:sparta_dir"  )
FileVectorOptionKey const evaluation::structural_similarity ( "evaluation:structural_similarity"  )
BooleanOptionKey const evaluation::symmetric_rmsd ( "evaluation:symmetric_rmsd"  )
IntegerOptionKey const evaluation::window_size ( "evaluation:window_size"  )