Rosetta  2020.37
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Functions
rna::denovo::minimize Namespace Reference

Functions

BooleanOptionKey const minimize ("rna:denovo:minimize")
 
IntegerOptionKey const minimize_rounds ("rna:denovo:minimize:minimize_rounds")
 
BooleanOptionKey const skip_coord_constraints ("rna:denovo:minimize:skip_coord_constraints")
 
BooleanOptionKey const skip_o2prime_trials ("rna:denovo:minimize:skip_o2prime_trials")
 
BooleanOptionKey const deriv_check ("rna:denovo:minimize:deriv_check")
 
BooleanOptionKey const minimizer_use_coordinate_constraints ("rna:denovo:minimize:minimizer_use_coordinate_constraints")
 
StringOptionKey const min_type ("rna:denovo:minimize:min_type")
 
BooleanOptionKey const minimize_bps ("rna:denovo:minimize:minimize_bps")
 
BooleanOptionKey const minimize_all_protein ("rna:denovo:minimize:minimize_all_protein")
 
BooleanOptionKey const minimize_protein_sc ("rna:denovo:minimize:minimize_protein_sc")
 
BooleanOptionKey const protein_packing ("rna:denovo:minimize:protein_packing")
 
BooleanOptionKey const protein_pack_all ("rna:denovo:minimize:protein_pack_all")
 
RealOptionKey const protein_packing_distance ("rna:denovo:minimize:protein_packing_distance")
 
ResidueChainVectorOptionKey const extra_minimize_res ("rna:denovo:minimize:extra_minimize_res")
 
ResidueChainVectorOptionKey const extra_minimize_chi_res ("rna:denovo:minimize:extra_minimize_chi_res")
 
BooleanOptionKey const minimize_use_nblist ("rna:denovo:minimize:minimize_use_nblist")
 
BooleanOptionKey const minimize_nblist_auto_update ("rna:denovo:minimize:minimize_nblist_auto_update")
 
IntegerOptionKey const minimize_max_iter ("rna:denovo:minimize:minimize_max_iter")
 

Function Documentation

BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::deriv_check ( "rna:denovo:minimize:deriv_check"  )
ResidueChainVectorOptionKey const rna::denovo::minimize::extra_minimize_chi_res ( "rna:denovo:minimize:extra_minimize_chi_res"  )
ResidueChainVectorOptionKey const rna::denovo::minimize::extra_minimize_res ( "rna:denovo:minimize:extra_minimize_res"  )
StringOptionKey const rna::denovo::minimize::min_type ( "rna:denovo:minimize:min_type"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize ( "rna:denovo:minimize"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_all_protein ( "rna:denovo:minimize:minimize_all_protein"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_bps ( "rna:denovo:minimize:minimize_bps"  )
IntegerOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_max_iter ( "rna:denovo:minimize:minimize_max_iter"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_nblist_auto_update ( "rna:denovo:minimize:minimize_nblist_auto_update"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_protein_sc ( "rna:denovo:minimize:minimize_protein_sc"  )
IntegerOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_rounds ( "rna:denovo:minimize:minimize_rounds"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimize_use_nblist ( "rna:denovo:minimize:minimize_use_nblist"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::minimizer_use_coordinate_constraints ( "rna:denovo:minimize:minimizer_use_coordinate_constraints"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::protein_pack_all ( "rna:denovo:minimize:protein_pack_all"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::protein_packing ( "rna:denovo:minimize:protein_packing"  )
RealOptionKey const rna::denovo::minimize::protein_packing_distance ( "rna:denovo:minimize:protein_packing_distance"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::skip_coord_constraints ( "rna:denovo:minimize:skip_coord_constraints"  )
BooleanOptionKey const rna::denovo::minimize::skip_o2prime_trials ( "rna:denovo:minimize:skip_o2prime_trials"  )