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 matdes
 
 matdes::mutalyze
 
 mc
 
 mean_field
 
 mh
 
 mh::score
 
 mh::path
 
 mh::harvest
 
 mh::match
 
 mh::dump
 
 mh::filter
 
 magnesium
 
 magnesium::montecarlo
 
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 ms
 
 ms::checkpoint
 
 mutate
 
 nmr
 
 nmr::pcs
 
 nmr::rdc
 
 nmr::pre
 

Functions

BooleanOptionKey const matdes::mutalyze::mutalyze ("matdes:mutalyze")
 
BooleanOptionKey const matdes::mutalyze::calc_rot_boltz ("matdes:mutalyze:calc_rot_boltz")
 
BooleanOptionKey const matdes::mutalyze::ala_scan ("matdes:mutalyze:ala_scan")
 
BooleanOptionKey const matdes::mutalyze::revert_scan ("matdes:mutalyze:revert_scan")
 
BooleanOptionKey const matdes::mutalyze::min_rb ("matdes:mutalyze:min_rb")
 
BooleanOptionKey const mc::mc ("mc")
 
BooleanOptionKey const mc::log_scores_in_MC ("mc:log_scores_in_MC")
 
StringOptionKey const mc::hierarchical_pool ("mc:hierarchical_pool")
 
FileOptionKey const mc::read_structures_into_pool ("mc:read_structures_into_pool")
 
IntegerOptionKey const mc::convergence_check_frequency ("mc:convergence_check_frequency")
 
FileOptionKey const mc::known_structures ("mc:known_structures")
 
RealOptionKey const mc::max_rmsd_against_known_structures ("mc:max_rmsd_against_known_structures")
 
IntegerVectorOptionKey const mc::excluded_residues_from_rmsd ("mc:excluded_residues_from_rmsd")
 
IntegerOptionKey const mc::heat_convergence_check ("mc:heat_convergence_check")
 
BooleanOptionKey const mean_field::mean_field ("mean_field")
 
FileVectorOptionKey const mean_field::bb_list ("mean_field:bb_list")
 
FileOptionKey const mean_field::dump_transfac ("mean_field:dump_transfac")
 
FileOptionKey const mean_field::spec_profile ("mean_field:spec_profile")
 
FileOptionKey const mean_field::bb_boltz_probs ("mean_field:bb_boltz_probs")
 
RealOptionKey const mean_field::rot_norm_weight ("mean_field:rot_norm_weight")
 
RealOptionKey const mean_field::bb_average_weight ("mean_field:bb_average_weight")
 
FileOptionKey const mean_field::rf_peptide ("mean_field:rf_peptide")
 
BooleanOptionKey const mean_field::include_all_aa ("mean_field:include_all_aa")
 
BooleanOptionKey const mean_field::ga_pack_detect_interface ("mean_field:ga_pack_detect_interface")
 
BooleanOptionKey const mean_field::biased_dist_all_gen ("mean_field:biased_dist_all_gen")
 
BooleanOptionKey const mh::mh ("mh")
 
StringOptionKey const mh::motif_out_file ("mh:motif_out_file")
 
FileVectorOptionKey const mh::harvest_motifs ("mh:harvest_motifs")
 
FileVectorOptionKey const mh::print_motifs ("mh:print_motifs")
 
FileVectorOptionKey const mh::remove_duplicates ("mh:remove_duplicates")
 
FileVectorOptionKey const mh::dump_motif_pdbs ("mh:dump_motif_pdbs")
 
FileVectorOptionKey const mh::merge_motifs ("mh:merge_motifs")
 
FileVectorOptionKey const mh::merge_scores ("mh:merge_scores")
 
BooleanOptionKey const mh::merge_motifs_one_per_bin ("mh:merge_motifs_one_per_bin")
 
BooleanOptionKey const mh::gen_reverse_motifs_on_load ("mh:gen_reverse_motifs_on_load")
 
FileVectorOptionKey const mh::dump_input_pdb ("mh:dump_input_pdb")
 
FileVectorOptionKey const mh::score_pdbs ("mh:score_pdbs")
 
FileVectorOptionKey const mh::sequence_recovery ("mh:sequence_recovery")
 
FileVectorOptionKey const mh::explicit_motif_score ("mh:explicit_motif_score")
 
FileVectorOptionKey const mh::harvest_scores ("mh:harvest_scores")
 
FileOptionKey const mh::print_scores ("mh:print_scores")
 
FileVectorOptionKey const mh::dump_matching_motifs ("mh:dump_matching_motifs")
 
BooleanOptionKey const mh::score_across_chains_only ("mh:score_across_chains_only")
 
BooleanOptionKey const mh::normalize_score_ncontact ("mh:normalize_score_ncontact")
 
IntegerOptionKey const mh::harvest_motifs_min_hh_ends ("mh:harvest_motifs_min_hh_ends")
 
BooleanOptionKey const mh::ignore_io_errors ("mh:ignore_io_errors")
 
RealOptionKey const mh::motif_match_radius ("mh:motif_match_radius")
 
RealVectorOptionKey const mh::merge_similar_motifs ("mh:merge_similar_motifs")
 
BooleanOptionKey const mh::score::score ("mh:score")
 
RealOptionKey const mh::score::background_weight ("mh:score:background_weight")
 
RealOptionKey const mh::score::ca_cb_clash_weight ("mh:score:ca_cb_clash_weight")
 
BooleanOptionKey const mh::score::noloops ("mh:score:noloops")
 
BooleanOptionKey const mh::score::nosheets ("mh:score:nosheets")
 
BooleanOptionKey const mh::score::nohelix ("mh:score:nohelix")
 
BooleanOptionKey const mh::score::spread_ss_element ("mh:score:spread_ss_element")
 
RealOptionKey const mh::score::min_cover_fraction ("mh:score:min_cover_fraction")
 
RealOptionKey const mh::score::strand_pair_weight ("mh:score:strand_pair_weight")
 
RealOptionKey const mh::score::anti_polar_weight ("mh:score:anti_polar_weight")
 
RealOptionKey const mh::score::min_contact_pairs ("mh:score:min_contact_pairs")
 
RealOptionKey const mh::score::max_contact_pairs ("mh:score:max_contact_pairs")
 
RealOptionKey const mh::score::max_cb_dis ("mh:score:max_cb_dis")
 
RealOptionKey const mh::score::coverage_pow ("mh:score:coverage_pow")
 
BooleanOptionKey const mh::score::use_ss1 ("mh:score:use_ss1")
 
BooleanOptionKey const mh::score::use_ss2 ("mh:score:use_ss2")
 
BooleanOptionKey const mh::score::use_aa1 ("mh:score:use_aa1")
 
BooleanOptionKey const mh::score::use_aa2 ("mh:score:use_aa2")
 
BooleanOptionKey const mh::score::use_log ("mh:score:use_log")
 
BooleanOptionKey const mh::path::path ("mh:path")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::biounit ("mh:path:biounit")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::biounit_ideal ("mh:path:biounit_ideal")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::pdb ("mh:path:pdb")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs ("mh:path:motifs")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_SC_SC ("mh:path:motifs_SC_SC")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_SC_BB ("mh:path:motifs_SC_BB")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_BB_BB ("mh:path:motifs_BB_BB")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_BB_PH ("mh:path:motifs_BB_PH")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_BB_PO ("mh:path:motifs_BB_PO")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::motifs_PH_PO ("mh:path:motifs_PH_PO")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores ("mh:path:scores")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_SC_SC ("mh:path:scores_SC_SC")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_SC_BB ("mh:path:scores_SC_BB")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_BB_BB ("mh:path:scores_BB_BB")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_BB_PH ("mh:path:scores_BB_PH")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_BB_PO ("mh:path:scores_BB_PO")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_PH_PO ("mh:path:scores_PH_PO")
 
StringVectorOptionKey const mh::path::scores_frags ("mh:path:scores_frags")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::harvest ("mh:harvest")
 
RealOptionKey const mh::harvest::hash_cart_resl ("mh:harvest:hash_cart_resl")
 
RealOptionKey const mh::harvest::hash_angle_resl ("mh:harvest:hash_angle_resl")
 
RealOptionKey const mh::harvest::smoothing_factor ("mh:harvest:smoothing_factor")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::idealize ("mh:harvest:idealize")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::dump ("mh:harvest:dump")
 
RealOptionKey const mh::harvest::min_bin_val ("mh:harvest:min_bin_val")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::sep_aa ("mh:harvest:sep_aa")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::sep_aa1 ("mh:harvest:sep_aa1")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::sep_aa2 ("mh:harvest:sep_aa2")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::sep_ss ("mh:harvest:sep_ss")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::sep_dssp ("mh:harvest:sep_dssp")
 
RealVectorOptionKey const mh::harvest::sep_lj ("mh:harvest:sep_lj")
 
RealVectorOptionKey const mh::harvest::sep_hb ("mh:harvest:sep_hb")
 
RealVectorOptionKey const mh::harvest::sep_nbrs ("mh:harvest:sep_nbrs")
 
RealVectorOptionKey const mh::harvest::sep_bfac ("mh:harvest:sep_bfac")
 
RealVectorOptionKey const mh::harvest::sep_dist ("mh:harvest:sep_dist")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::weight_by_energy ("mh:harvest:weight_by_energy")
 
RealOptionKey const mh::harvest::max_rmsd ("mh:harvest:max_rmsd")
 
IntegerOptionKey const mh::harvest::max_res ("mh:harvest:max_res")
 
BooleanOptionKey const mh::harvest::agg_with_max ("mh:harvest:agg_with_max")
 
RealOptionKey const mh::harvest::multiplier ("mh:harvest:multiplier")
 
BooleanOptionKey const mh::match::match ("mh:match")
 
BooleanOptionKey const mh::match::interface_only ("mh:match:interface_only")
 
BooleanOptionKey const mh::match::ss ("mh:match:ss")
 
BooleanOptionKey const mh::match::ss1 ("mh:match:ss1")
 
BooleanOptionKey const mh::match::ss2 ("mh:match:ss2")
 
BooleanOptionKey const mh::match::aa ("mh:match:aa")
 
BooleanOptionKey const mh::match::aa1 ("mh:match:aa1")
 
BooleanOptionKey const mh::match::aa2 ("mh:match:aa2")
 
BooleanOptionKey const mh::dump::dump ("mh:dump")
 
IntegerOptionKey const mh::dump::limit_per_pair ("mh:dump:limit_per_pair")
 
IntegerOptionKey const mh::dump::max_per_res ("mh:dump:max_per_res")
 
RealOptionKey const mh::dump::max_ca_dis ("mh:dump:max_ca_dis")
 
RealOptionKey const mh::dump::max_rms ("mh:dump:max_rms")
 
RealOptionKey const mh::dump::resfile_min_pair_score ("mh:dump:resfile_min_pair_score")
 
RealOptionKey const mh::dump::resfile_min_tot_score ("mh:dump:resfile_min_tot_score")
 
BooleanOptionKey const mh::dump::resfile_dump ("mh:dump:resfile_dump")
 
BooleanOptionKey const mh::dump::symmetric_motifs ("mh:dump:symmetric_motifs")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::filter ("mh:filter")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::filter_harvest ("mh:filter:filter_harvest")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::filter_io ("mh:filter:filter_io")
 
StringOptionKey const mh::filter::pdb ("mh:filter:pdb")
 
StringOptionKey const mh::filter::lig ("mh:filter:lig")
 
StringOptionKey const mh::filter::motif_type ("mh:filter:motif_type")
 
StringOptionKey const mh::filter::restype1 ("mh:filter:restype1")
 
StringOptionKey const mh::filter::restype2 ("mh:filter:restype2")
 
StringOptionKey const mh::filter::restype ("mh:filter:restype")
 
StringOptionKey const mh::filter::restype_one ("mh:filter:restype_one")
 
StringOptionKey const mh::filter::not_restype ("mh:filter:not_restype")
 
StringOptionKey const mh::filter::not_restype_one ("mh:filter:not_restype_one")
 
IntegerOptionKey const mh::filter::seqsep ("mh:filter:seqsep")
 
IntegerOptionKey const mh::filter::max_seqsep ("mh:filter:max_seqsep")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::no_hb_bb ("mh:filter:no_hb_bb")
 
RealOptionKey const mh::filter::mindist2 ("mh:filter:mindist2")
 
RealOptionKey const mh::filter::maxdist2 ("mh:filter:maxdist2")
 
StringOptionKey const mh::filter::ss1 ("mh:filter:ss1")
 
StringOptionKey const mh::filter::ss2 ("mh:filter:ss2")
 
StringOptionKey const mh::filter::dssp1 ("mh:filter:dssp1")
 
StringOptionKey const mh::filter::dssp2 ("mh:filter:dssp2")
 
StringOptionKey const mh::filter::aa1 ("mh:filter:aa1")
 
StringOptionKey const mh::filter::aa2 ("mh:filter:aa2")
 
RealOptionKey const mh::filter::sasa ("mh:filter:sasa")
 
RealOptionKey const mh::filter::faatr ("mh:filter:faatr")
 
RealOptionKey const mh::filter::hb_sc ("mh:filter:hb_sc")
 
RealOptionKey const mh::filter::hb_bb_sc ("mh:filter:hb_bb_sc")
 
RealOptionKey const mh::filter::hb_bb ("mh:filter:hb_bb")
 
RealOptionKey const mh::filter::occupancy ("mh:filter:occupancy")
 
RealOptionKey const mh::filter::coorderr ("mh:filter:coorderr")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::uniformfrag ("mh:filter:uniformfrag")
 
RealOptionKey const mh::filter::faatr_or_hbbb ("mh:filter:faatr_or_hbbb")
 
RealOptionKey const mh::filter::faatr_or_hb ("mh:filter:faatr_or_hb")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::noloops ("mh:filter:noloops")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::oneloop ("mh:filter:oneloop")
 
BooleanOptionKey const mh::filter::nodisulf ("mh:filter:nodisulf")
 
RealOptionKey const mh::filter::score ("mh:filter:score")
 
BooleanOptionKey const magnesium::magnesium ("magnesium")
 
BooleanOptionKey const magnesium::scan ("magnesium:scan")
 
IntegerVectorOptionKey const magnesium::mg_res ("magnesium:mg_res")
 
BooleanOptionKey const magnesium::minimize_during_scoring ("magnesium:minimize_during_scoring")
 
ResidueChainVectorOptionKey const magnesium::ligand_res ("magnesium:ligand_res")
 
IntegerVectorOptionKey const magnesium::pose_ligand_res ("magnesium:pose_ligand_res")
 
BooleanOptionKey const magnesium::lores_scan ("magnesium:lores_scan")
 
RealOptionKey const magnesium::xyz_step ("magnesium:xyz_step")
 
RealOptionKey const magnesium::score_cut ("magnesium:score_cut")
 
RealOptionKey const magnesium::score_cut_PDB ("magnesium:score_cut_PDB")
 
BooleanOptionKey const magnesium::integration_test ("magnesium:integration_test")
 
BooleanOptionKey const magnesium::tether_to_closest_res ("magnesium:tether_to_closest_res")
 
BooleanOptionKey const magnesium::fixup ("magnesium:fixup")
 
BooleanOptionKey const magnesium::pack_water_hydrogens ("magnesium:pack_water_hydrogens")
 
BooleanOptionKey const magnesium::hydrate ("magnesium:hydrate")
 
BooleanOptionKey const magnesium::monte_carlo ("magnesium:monte_carlo")
 
BooleanOptionKey const magnesium::scored_hydrogen_sampling ("magnesium:scored_hydrogen_sampling")
 
BooleanOptionKey const magnesium::all_hydration_frames ("magnesium:all_hydration_frames")
 
BooleanOptionKey const magnesium::leave_other_waters ("magnesium:leave_other_waters")
 
BooleanOptionKey const magnesium::minimize ("magnesium:minimize")
 
RealOptionKey const magnesium::minimize_mg_coord_constraint_distance ("magnesium:minimize_mg_coord_constraint_distance")
 
BooleanOptionKey const magnesium::montecarlo::montecarlo ("magnesium:montecarlo")
 
RealOptionKey const magnesium::montecarlo::temperature ("magnesium:montecarlo:temperature")
 
IntegerOptionKey const magnesium::montecarlo::cycles ("magnesium:montecarlo:cycles")
 
BooleanOptionKey const magnesium::montecarlo::dump ("magnesium:montecarlo:dump")
 
RealOptionKey const magnesium::montecarlo::add_delete_frequency ("magnesium:montecarlo:add_delete_frequency")
 
BooleanOptionKey const motifs::motifs ("motifs")
 
RealOptionKey const motifs::close_enough ("motifs:close_enough")
 
IntegerOptionKey const motifs::max_depth ("motifs:max_depth")
 
BooleanOptionKey const motifs::keep_motif_xtal_location ("motifs:keep_motif_xtal_location")
 
RealOptionKey const motifs::pack_score_cutoff ("motifs:pack_score_cutoff")
 
RealOptionKey const motifs::hb_score_cutoff ("motifs:hb_score_cutoff")
 
RealOptionKey const motifs::water_score_cutoff ("motifs:water_score_cutoff")
 
RealOptionKey const motifs::pack_min_threshold ("motifs:pack_min_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::pack_max_threshold ("motifs:pack_max_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::hbond_min_threshold ("motifs:hbond_min_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::hbond_max_threshold ("motifs:hbond_max_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::elec_min_threshold ("motifs:elec_min_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::elec_max_threshold ("motifs:elec_max_threshold")
 
RealOptionKey const motifs::duplicate_dist_cutoff ("motifs:duplicate_dist_cutoff")
 
RealOptionKey const motifs::duplicate_angle_cutoff ("motifs:duplicate_angle_cutoff")
 
StringOptionKey const motifs::motif_output_directory ("motifs:motif_output_directory")
 
BooleanOptionKey const motifs::eliminate_weak_motifs ("motifs:eliminate_weak_motifs")
 
RealOptionKey const motifs::duplicate_motif_cutoff ("motifs:duplicate_motif_cutoff")
 
BooleanOptionKey const motifs::preminimize_motif_pdbs ("motifs:preminimize_motif_pdbs")
 
BooleanOptionKey const motifs::preminimize_motif_pdbs_sconly ("motifs:preminimize_motif_pdbs_sconly")
 
BooleanOptionKey const motifs::place_adduct_waters ("motifs:place_adduct_waters")
 
FileVectorOptionKey const motifs::list_motifs ("motifs:list_motifs")
 
StringOptionKey const motifs::motif_filename ("motifs:motif_filename")
 
StringOptionKey const motifs::file_prefix ("motifs:file_prefix")
 
StringOptionKey const motifs::build_residue_file ("motifs:build_residue_file")
 
StringOptionKey const motifs::motif_flexible_loop_file ("motifs:motif_flexible_loop_file")
 
StringOptionKey const motifs::residue_trim_file ("motifs:residue_trim_file")
 
StringOptionKey const motifs::BPData ("motifs:BPData")
 
FileVectorOptionKey const motifs::list_dnaconformers ("motifs:list_dnaconformers")
 
StringVectorOptionKey const motifs::target_dna_defs ("motifs:target_dna_defs")
 
StringVectorOptionKey const motifs::motif_build_defs ("motifs:motif_build_defs")
 
IntegerVectorOptionKey const motifs::motif_build_positions ("motifs:motif_build_positions")
 
RealOptionKey const motifs::r1 ("motifs:r1")
 
RealOptionKey const motifs::r2 ("motifs:r2")
 
RealOptionKey const motifs::z1 ("motifs:z1")
 
RealOptionKey const motifs::z2 ("motifs:z2")
 
RealOptionKey const motifs::dtest ("motifs:dtest")
 
IntegerOptionKey const motifs::rotlevel ("motifs:rotlevel")
 
IntegerOptionKey const motifs::num_repacks ("motifs:num_repacks")
 
BooleanOptionKey const motifs::minimize ("motifs:minimize")
 
BooleanOptionKey const motifs::minimize_dna ("motifs:minimize_dna")
 
BooleanOptionKey const motifs::run_motifs ("motifs:run_motifs")
 
BooleanOptionKey const motifs::expand_motifs ("motifs:expand_motifs")
 
BooleanOptionKey const motifs::aromatic_motifs ("motifs:aromatic_motifs")
 
BooleanOptionKey const motifs::dump_motifs ("motifs:dump_motifs")
 
BooleanOptionKey const motifs::quick_and_dirty ("motifs:quick_and_dirty")
 
RealOptionKey const motifs::special_rotweight ("motifs:special_rotweight")
 
StringOptionKey const motifs::output_file ("motifs:output_file")
 
StringOptionKey const motifs::data_file ("motifs:data_file")
 
StringOptionKey const motifs::target_aa ("motifs:target_aa")
 
BooleanOptionKey const motifs::flex_sugar ("motifs:flex_sugar")
 
BooleanOptionKey const motifs::clear_bprots ("motifs:clear_bprots")
 
IntegerOptionKey const motifs::rots2add ("motifs:rots2add")
 
BooleanOptionKey const motifs::restrict_to_wt ("motifs:restrict_to_wt")
 
BooleanOptionKey const motifs::rerun_motifsearch ("motifs:rerun_motifsearch")
 
BooleanOptionKey const motifs::no_rotamer_bump ("motifs:no_rotamer_bump")
 
RealOptionKey const motifs::ligand_motif_sphere ("motifs:ligand_motif_sphere")
 
BooleanOptionKey const ms::ms ("ms")
 
IntegerOptionKey const ms::pop_from_ss ("ms:pop_from_ss")
 
IntegerOptionKey const ms::pop_size ("ms:pop_size")
 
IntegerOptionKey const ms::generations ("ms:generations")
 
IntegerOptionKey const ms::num_packs ("ms:num_packs")
 
IntegerOptionKey const ms::numresults ("ms:numresults")
 
RealOptionKey const ms::anchor_offset ("ms:anchor_offset")
 
RealOptionKey const ms::Boltz_temp ("ms:Boltz_temp")
 
RealOptionKey const ms::mutate_rate ("ms:mutate_rate")
 
RealOptionKey const ms::fraction_by_recombination ("ms:fraction_by_recombination")
 
BooleanOptionKey const ms::checkpoint::checkpoint ("ms:checkpoint")
 
StringOptionKey const ms::checkpoint::prefix ("ms:checkpoint:prefix")
 
IntegerOptionKey const ms::checkpoint::interval ("ms:checkpoint:interval")
 
BooleanOptionKey const ms::checkpoint::gz ("ms:checkpoint:gz")
 
BooleanOptionKey const ms::checkpoint::rename ("ms:checkpoint:rename")
 
BooleanOptionKey const mutate::mutate ("mutate")
 
StringVectorOptionKey const mutate::mutation ("mutate:mutation")
 
StringOptionKey const mutate::mutant_file ("mutate:mutant_file")
 
BooleanOptionKey const nmr::nmr ("nmr")
 
BooleanOptionKey const nmr::pcs::pcs ("nmr:pcs")
 
FileOptionKey const nmr::pcs::input_file ("nmr:pcs:input_file")
 
IntegerOptionKey const nmr::pcs::nls_repeats ("nmr:pcs:nls_repeats")
 
BooleanOptionKey const nmr::pcs::optimize_tensor ("nmr:pcs:optimize_tensor")
 
RealVectorOptionKey const nmr::pcs::multiset_weights ("nmr:pcs:multiset_weights")
 
BooleanOptionKey const nmr::pcs::normalize_data ("nmr:pcs:normalize_data")
 
BooleanOptionKey const nmr::pcs::use_symmetry_calc ("nmr:pcs:use_symmetry_calc")
 
BooleanOptionKey const nmr::pcs::show_info ("nmr:pcs:show_info")
 
BooleanOptionKey const nmr::rdc::rdc ("nmr:rdc")
 
FileOptionKey const nmr::rdc::input_file ("nmr:rdc:input_file")
 
IntegerOptionKey const nmr::rdc::nls_repeats ("nmr:rdc:nls_repeats")
 
RealVectorOptionKey const nmr::rdc::multiset_weights ("nmr:rdc:multiset_weights")
 
BooleanOptionKey const nmr::rdc::use_symmetry_calc ("nmr:rdc:use_symmetry_calc")
 
BooleanOptionKey const nmr::rdc::show_info ("nmr:rdc:show_info")
 
StringOptionKey const nmr::rdc::normalization_type ("nmr:rdc:normalization_type")
 
BooleanOptionKey const nmr::rdc::correct_sign ("nmr:rdc:correct_sign")
 
BooleanOptionKey const nmr::pre::pre ("nmr:pre")
 
FileOptionKey const nmr::pre::input_file ("nmr:pre:input_file")
 
IntegerOptionKey const nmr::pre::nls_repeats ("nmr:pre:nls_repeats")
 
BooleanOptionKey const nmr::pre::optimize_para_ion_position ("nmr:pre:optimize_para_ion_position")
 
RealVectorOptionKey const nmr::pre::multiset_weights ("nmr:pre:multiset_weights")
 
BooleanOptionKey const nmr::pre::normalize_data ("nmr:pre:normalize_data")
 
BooleanOptionKey const nmr::pre::use_symmetry_calc ("nmr:pre:use_symmetry_calc")