You are here

Re-building protocol crash

1 post / 0 new
Re-building protocol crash
#1

Dear all,
I'm trying to using rosetta to execute following protocol:

aa t000 _ -relax -looprlx -nstruct 10 -fa_input -use_sspair -random_loop -termini -idl_no_chain_break -loop_skip_rate 0.0 -vary_omega -l pdbs.list

but after creation of 1-7 on 200 decoys roserra crash with this error:

WARNING: pose::set_fold_tree reordering tree at 1
bad fold tree!
FOLD_TREE EDGE 1 8 -1 EDGE 8 13 1 EDGE 8 9 -1 EDGE 13 10 -1 EDGE 13 28 -1 EDGE 28 44 2 EDGE 28 29 -1 EDGE 44 30 -1 EDGE 44 49 -1 EDGE 49 62 3 EDGE 49 59 -1 EDGE 62 60 -1 EDGE 62 61 -1 EDGE 61 79 4 EDGE 61 66 -1 EDGE 79 67 -1 EDGE 79 84 -1

STOP:: bad fold_tree!FOLD_TREE EDGE 1 8 -1 EDGE 8 13 1 EDGE 8 9 -1 EDGE 13 10 -1 EDGE 13 28 -1 EDGE 28 44 2 EDGE 28 29 -1 EDGE 44 30 -1 EDGE 44 49 -1 EDGE 49 62 3 EDGE 49 59 -1 EDGE 62 60 -1 EDGE 62 61 -1 EDGE 61 79 4 EDGE 61 66 -1 EDGE 79 67 -1 EDGE 79 84 -1

ERROR:: Exit from: pose.cc line: 800

Please, if someone knows a possible source of my errors let me know

Lucio

Post Situation: 
Sun, 2011-03-13 05:28
murgantia