You are here

Rosettascript - change residue number and chain ID

1 post / 0 new
Rosettascript - change residue number and chain ID
#1

I was trying to use Rosettascript to perform a grafting task. I found that an intermediate pose of my task has the following discontinuity of residue number.

ATOM    344  N   GLY  A  5     184.005 155.908 153.713  1.00  0.00           N
ATOM    345  CA  GLY  A  5     183.461 154.563 153.563  1.00  0.00           C
ATOM    346  C   GLY  A  5     182.084 154.595 152.912  1.00  0.00           C
ATOM    347  O   GLY  A  5     181.338 155.562 153.064  1.00  0.00           O
ATOM    348  H   GLY  A  5     184.088 156.305 154.638  1.00  0.00           H
ATOM    349 1HA  GLY  A  5     184.140 153.962 152.958  1.00  0.00           H
ATOM    350 2HA  GLY  A  5     183.395 154.087 154.540  1.00  0.00           H
ATOM    351  N   GLY     0     181.753 153.532 152.188  1.00  0.00           N
ATOM    352  CA  GLY     0     180.465 153.436 151.512  1.00  0.00           C
ATOM    353  C   GLY     0     179.336 153.206 152.509  1.00  0.00           C
ATOM    354  O   GLY     0     179.561 152.704 153.610  1.00  0.00           O
ATOM    355  H   GLY     0     182.411 152.770 152.102  1.00  0.00           H
ATOM    356 1HA  GLY     0     180.279 154.353 150.952  1.00  0.00           H
ATOM    357 2HA  GLY     0     180.491 152.619 150.792  1.00  0.00           H
ATOM    358  N   GLY  A  7     178.079 153.534 152.229  1.00  0.00           N
ATOM    359  CA  GLY  A  7     177.095 153.260 153.269  1.00  0.00           C
ATOM    360  C   GLY  A  7     177.109 154.344 154.339  1.00  0.00           C
ATOM    361  O   GLY  A  7     176.419 154.239 155.353  1.00  0.00           O
ATOM    362  H   GLY  A  7     177.774 153.950 151.360  1.00  0.00           H
ATOM    363 1HA  GLY  A  7     176.103 153.196 152.824  1.00  0.00           H
ATOM    364 2HA  GLY  A  7     177.306 152.293 153.724  1.00  0.00           H

 

I'm wondering within the framework of Rosettascript, can I correct the residue number and the chain ID? The desired output is shown below. (The modified content is in bold.)

ATOM    344  N   GLY  A  5     184.005 155.908 153.713  1.00  0.00           N
ATOM    345  CA  GLY  A  5     183.461 154.563 153.563  1.00  0.00           C
ATOM    346  C   GLY  A  5     182.084 154.595 152.912  1.00  0.00           C
ATOM    347  O   GLY  A  5     181.338 155.562 153.064  1.00  0.00           O
ATOM    348  H   GLY  A  5     184.088 156.305 154.638  1.00  0.00           H
ATOM    349 1HA  GLY  A  5     184.140 153.962 152.958  1.00  0.00           H
ATOM    350 2HA  GLY  A  5     183.395 154.087 154.540  1.00  0.00           H
ATOM    351  N   GLY  A  6     181.753 153.532 152.188  1.00  0.00           N
ATOM    352  CA  GLY  A  6     180.465 153.436 151.512  1.00  0.00           C
ATOM    353  C   GLY  A  6     179.336 153.206 152.509  1.00  0.00           C
ATOM    354  O   GLY  A  6     179.561 152.704 153.610  1.00  0.00           O
ATOM    355  H   GLY  A  6     182.411 152.770 152.102  1.00  0.00           H
ATOM    356 1HA  GLY  A  6     180.279 154.353 150.952  1.00  0.00           H
ATOM    357 2HA  GLY  A  6     180.491 152.619 150.792  1.00  0.00           H
ATOM    358  N   GLY  A  7     178.079 153.534 152.229  1.00  0.00           N
ATOM    359  CA  GLY  A  7     177.095 153.260 153.269  1.00  0.00           C
ATOM    360  C   GLY  A  7     177.109 154.344 154.339  1.00  0.00           C
ATOM    361  O   GLY  A  7     176.419 154.239 155.353  1.00  0.00           O
ATOM    362  H   GLY  A  7     177.774 153.950 151.360  1.00  0.00           H
ATOM    363 1HA  GLY  A  7     176.103 153.196 152.824  1.00  0.00           H
ATOM    364 2HA  GLY  A  7     177.306 152.293 153.724  1.00  0.00           H

 

Category: 
Post Situation: 
Wed, 2022-09-14 23:40
cttm4a1